ก่อตั้งขึ้นจากกลุ่มบุคลากรที่สนใจทางด้านซอฟต์แวร์ระบบโรงพยาบาลและห้องปฏิบัติการ  โดยเริ่มมีแนวความคิดหลังจากงานประชุมประจำปี 2545 ของชมรมข่าวสารข้อมูลทางการแพทย์และสาธารณสุขแห่งประเทศไทย(TMI) โดยคณะกรรมการได้มองเห็นว่านับวันเทคโนโลยีสารสนเทศจะมีส่วนเกี่ยวข้องกับระบบงานทางด้านโรงพยาบาลและระบบสาธารณสุขของไทยมากขึ้น โดยเฉพาะเรื่องซอฟต์แวร์ที่ส่วนมากจะเป็นการซื้อมาใช้มากกว่าการพัฒนาขึ้นมาใช้โดยคนไทยเอง ดังนั้น จากการปรึกษาหารือกันระหว่างผู้เข้าร่วมประชุมและคณะกรรมการ ได้มีความคิดเห็นร่วมกันในการที่จะร่วมกันก่อตั้ง ชมรม HIS/LIS แห่งประเทศไทยขึ้น